新疆的大学主要有：新疆大学、石河子大学、新疆医科大学、新疆师范大学、新疆农业大学、新疆财经大学、塔里木大学、伊犁师范大学、喀什大学、昌吉学院、新疆警察学院、新疆艺术学院、新疆工程学院、新疆理工学院、新疆农业大学科学技术学院、新疆医科大学厚博学院、新疆科技学院、石河子大学科技学院、新疆天山职业技术大学。
补充资料：
1、新疆大学：
新疆大学是一所有着悠久办学历史、光荣革命传统、鲜明办学特色的综合性大学，在国家高等教育布局中具有重要的作用和特殊的区域地位，是自治区高等教育的领头羊和排头兵。学校是上海合作组织大学项目学校、教育部富布莱特项目学校、教育部美大处项目学校，是中国政府奖学金自主招生项目学校、孔子学院奖学金项目学校和新疆政府奖学金项目学校。
2、石河子大学：
石河子大学是国家“211工程”重点建设高校、国家西部重点建设高校和省部共建高校，是“中西部高校基础能力建设工程”和“中西部高校综合实力提升工程”（一省一校）入选高校。2017年学校入选国家“双一流”建设一流学科建设高校，2018年入选“部省合建”高校，纳入教育部直属高校排序。 近年来，学校先后荣获“全国普通高校毕业生就业工作先进集体”、“全国毕业生就业典型经验50所高校”等荣誉称号。
3、新疆医科大学：
新疆医科大学，坐落于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市风景秀丽的鲤鱼山下，是一所具有光荣传统的省属重点大学，入选“卓越医生教育培养计划”、“中国政府奖学金来华留学生接收院校”，是国家卫生和计划生育委员会、教育部和新疆自治区共建高校。其前身新疆医学院始建于1954年，1956年建成招生，1998年6月新疆医学院与新疆中医学院合并成立了新疆医科大学。
4、新疆师范大学：
新疆师范大学创立于1978年12月，其前身是乌鲁木齐第一师范学校和新疆教师培训部。学校被国家汉办授予“孔子学院优秀中方承办院校”，并成为上海合作组织大学中方院校，学校先后荣获全国先进基层党组织、全国民族团结进步先进集体、自治区先进基层党组织、开发建设新疆先进集体、自治区文明单位等荣誉称号。