药学专业知识二考试题型均为选择题。具体有A型题（最佳选择题）、B型题（配伍选择题）、C型题（综合分析选择题）和X型题（多项选择题）四种。
药学专业知识二考120道题，其中A型题40道，B型题60道，C型题10道，X型题10道。药学专业知识二考试每题1分，满分120分，分数线一般以满分的60%来划分，即72分合格。
药学专业知识二考试成绩四年滚动，参加药学专业知识二考试的成绩在连续四个考试年度内有效。如：2020年+2021年+2022年+2023年或2021年+2022年+2023年+2024年这样的组合方式。
符合《执业药师职业资格制度规定》报考条件，按照有关规定取得药学或医学专业高级职称并在药学岗位工作的，可免试药学专业知识二科目。